辅佐之后，已然彻底蜕变。他不再被朝臣裹挟，不再被旧制束缚，面对这些蛀空大明江山的蠹虫，他不再有丝毫手软，选择以雷霆手段，肃清朝堂，扫清新政路上的所有障碍。
锦衣卫缇骑四出，京城之内，相关官员府邸尽数被查抄，账册、书信、赃银被一一起获，贪腐证据一查一串，牵出的蛀虫不计其数。一日之内，京城朝堂经历惊天清洗，勾结江南贪腐势力的内奸尽数落网，朝野上下，为之震动，满朝文武人人自危，满心震慑，至此，再也无人敢对江南新政、对诸葛亮清查之事，有半分非议，半分阻挠。