教徒，包括犹太人和穆斯林进行了迫害，并成立了宗教裁判所。就在1492年，20万拥有财富和技术的犹太人被驱逐出境，10年后摩尔人遭到了相同的命运。这也许是中世纪所有虔诚国王共有的缺憾，他们在天主教世界中得到广泛尊敬，却心安理得地对异教徒犯下了罪行。他们的宗教政策被后继者们延续下去，在卡洛斯一世和腓力二世时代达到极点。在宗教审判制度下，西班牙失去了灵气，逐渐变成一个死气沉沉的角落(而与此同时，绚烂的文艺复兴运动正在其它欧洲国家蔓延)。
资助哥伦布
“为了某些理由和目的，我们派遣高贵的克里斯托瓦尔·哥伦布率领三条装备良好的帆船，携带一些礼物飘洋过海，走向印度地区“--伊莎贝尔一世夫妇发给哥伦布的通行证。
资助了哥伦布的壮举。这个落魄的浪子在经过10年的碰壁之后，终于在伊莎贝尔的宫廷中获得了理想的新生。哥伦布的伟大构想得到女王的欣赏并得到慷慨资助，据说伊莎贝尔甚至拿出自己的私房钱来，哥伦布被封为海洋舰队司令和将发现土地的总督。1492年，这个西班牙历史上最伟大的年份，哥伦布的探险队经过70天航行之后，终于到达北美洲的巴哈马群岛。新大陆的发现，给西班牙带来了广阔的未来空间。此后一个世纪，西班牙依靠广阔的海外领地和源源不断的黄金输入，确立了世界霸权。
对于历史上每一对夫妻国王来说，很难将各自的作用严格划分开来。她与斐迪南二世是“强强组合“，不过传统上认为她的作用要更加突出。在这中间，斐迪南二世的许多努力可能也被归到了伊莎贝尔的名下。单就赞助哥伦布远航这件事而论，她就足以排进世界最有影响的帝王的行列。已有旧大陆的人在哥伦布之前到达美洲的几种假说，但无论如何，只有哥伦布的壮举才开辟了新航线，将新旧大陆连为一体。另一方面，是西班牙而不是其它国家率先占有了美洲，这使美洲大部分地区的文化打上了西班牙的烙印，一直延续到今天。由于西班牙在此后100多年里建立了霸权，她留下的影响也超出了伊比利亚半岛的范围，远达拉丁美洲、尼德兰等地。
人物评价
由于伊莎贝尔鲜明的个性和魅力，使人们极易过高的评价她在历史上的影响。她的业绩也许首先在于支持了哥伦布探
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